De la medicina de precisión a la sostenibilidad

Que Centro de Supercomputación de Barcelona (BSC) Y lenovo han firmado un acuerdo de colaboración por el que la empresa tecnológica invertirá siete millones de dólares en la institución de supercomputación durante tres años. Sin embargo, este acuerdo va más allá de lo económico, ya que la idea es estudiar nuevas tecnologías hacia la medicina de precisión, la creación de nuevos superordenadores y la sostenibilidad, en línea con las líneas de investigación prioritarias de la Comisión Europea.

Además, la idea es llevar estas nuevas tecnologías de supercomputación a la era de la exaescala e introducir una arquitectura abierta para ayudar a los científicos e investigadores con plataformas de supercomputación más inteligentes, eficientes y sostenibles.

Cabe señalar que la supercomputadora MareNostrum 5, recientemente adquirida y que se instalará en el BSC, tendrá un rendimiento máximo de 314 PFlops o igual a 314 mil millones de cálculos por segundo, más de 200 PB de memoria y 400 PB de archivo activo.

Este superordenador se diseñará específicamente para apoyar la investigación médica europea en el desarrollo de nuevos medicamentos, desarrollo de vacunas, simulaciones de propagación de virus, aplicaciones de inteligencia artificial y análisis de big data. La máquina también admitirá aplicaciones tradicionales de supercomputación, como la investigación climática, la ingeniería, la ciencia de los materiales y la ciencia de la tierra.

medicina de precisión

El acuerdo entre el BSC y Lenovo tiene como objetivo mejorar y acelerar la medicina de precisión mediante el uso de la supercomputación. Por ello, un equipo del BSC-CNS, liderado por el investigador Miquel Moretó, estudiará algoritmos de análisis del genoma para el diseño de nuevos aceleradores que se integrarán en las plataformas HPC del futuro y servirán para aumentar la eficiencia de estos sofisticados analiza

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Estos HPC son recursos informáticos de alto rendimiento que, junto con el análisis eficiente de grandes datos genómicos, serán clave para el avance de la medicina de precisión y el desarrollo de nuevos tratamientos para enfermedades como el cáncer.

“Los algoritmos creados y optimizados por el equipo de BSC-CNS se integrarán en la herramienta GOAST desarrollada por Lenovo en 2019 para agilizar y mejorar el análisis genómico”, dice el comunicado. Además, estas herramientas analíticas se extenderán a otras disciplinas como la epigenética, la metagenómica, la microbiología, la virología y otras áreas de las ciencias de la vida y la salud.

nuevas supercomputadoras

Como se informó anteriormente en Innovaspain, El BSC diseña y desarrolla tecnología de chips en Europa, basada en la arquitectura de conjunto de instrucciones abiertas -RISC-V, en el Laboratorio Europeo de Arquitectura de Computación Abierta (LOCA). La participación de Lenovo en este proyecto de supercomputación ayudará a facilitar el progreso hacia esta prioridad para Europa. En el mismo contexto con LOCA, el BSC también anunció recientemente la creación de un laboratorio conjunto con INTEL para desarrollar chips con tecnología europea.

sustentabilidad

Finalmente, la investigación conjunta de BSC y Lenovo tiene como objetivo construir supercomputadoras y “centros de datos” de una manera más eficiente energéticamente, sostenible y rentable. El grupo coordinado por la investigadora Julita Corbalán liderará este desafío en el BSC-CNS. De hecho, en 2016 su equipo, junto con Lenovo, desarrolló un nuevo software (EAR, Energy Aware Runtime) para la optimización y eficiencia energética de herramientas HPC y, junto con UPC, lanzó el spin-off EAS (Energy Aware Solutions) para ir más en esta dirección.

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Este nuevo proyecto de investigación en supercomputación buscará sistemas más potentes, flexibles y robustos para ahorrar energía en estas infraestructuras. Para ello, por un lado, “aspirará a la creación de software de optimización energética y gestión energética, para lo que estudiará la incorporación de las nuevas tecnologías desarrolladas por INTEL a los algoritmos desarrollados recientemente por el equipo de Corbalán al efecto. ; Por otro lado, se está intentando extender y monitorizar el control del consumo energético a toda la infraestructura, no solo a la parte informática de las máquinas, lo que también favorecerá el ahorro energético”, indican.

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